近年来，经开区管委会在抓好招商引资和项目建设的同时，以创建创新型园区为主线，积极引导和鼓励企业进行科技创新，一是落实国家、省、市对科技企业的奖励和政策兑现；二是鼓励企业加大对研发经费的投入；三是积极为企业申报各类科技项目提供服务和便利；四是加大对企业引进人才和培养人才的奖励力度。通过不懈的努力，经开区经济得到快速、健康的发展。
截至到目前，经开区内共有国家级创新型企业1家，省级高新技术企业9个，安徽省阜阳市创新型企业21家，拥有省级工程技术研究中心6个，省级企业技术中心13个，企业研发机构33个，承担国家创新基金成果转化项目32个，省、市级科技攻关计划项目38项，经开区企业共申请专利672项，获得授权548项。（经开区）